Encontrei esta dica e personalizei-a http://lifehacker.com/5596006/create-an-application-shortcut-to-open-nautilus-as-root-in-ubuntu
Quer navegar pelas pastas do sistema e puder mover, apagar, editar, criar ficheiros e pastas e alterar as suas permissões

- Ou aprende os comandos para usar na consola do terminal ou então opta por uma das 2 opções que descrevo mais abaixo.
Para navegar pelas pastas do sistema de ficheiros, com privilégios de root e assim efectuar muitas das operações que só poderíamos efectuar pela consola do terminal, existem pelo menos 2 métodos:
1. Criar um atalho para o Nautilus com privilégios de root:
- Abra a consola do terminal com a combinação de teclas ctrl+alt+t .

- Digite o seguinte comando na consola do terminal:
sudo gedit /usr/share/applications/Nautilus-root.desktop

- Pressione a tecla Enter
-Agora digite a sua password:

Nota: enquanto digita o cursor não se move, mas não se preocupe que os caracteres estão lá.
- Pressione a tecla Enter
- Será aberta uma janela do Gedit:

- Agora copie o seguinte código para o editor de texto Gedit:
- Código: Selecionar todos
[Desktop Entry]
Name=Nautilus for Root
Comment=Browse the filesystem with the file manager with root privileges
Exec=gksudo nautilus
Icon=folder-publicshare
Terminal=false
Type=Application
Categories=Application;System;

- Depois grave o ficheiro, clicando em Guardar ou Save e feche o editor .

- Abra o Dash

-Agora digite na linha de comandos do dash:
gksudo nautilus

- Clique no icon, introduza a password na janela que lhe vai aparecer

- Começe a navegar pelas suas pastas e ficheiros com permissôes de root


2. Executar directamente pela consola do terminal:
- Abra a consola do terminal com a combinação de teclas ctrl+alt+t .

- Agora digite:
sudo nautilus

- Pressione a tecla Enter
-Agora digite a sua password:

Nota: enquanto digita o cursor não se move, mas não se preocupe que os caracteres estão lá.
- Pressione a tecla Enter
- Será aberta uma janela do nautilus com permissões de root.

Espero que tenham gostado e tirem proveito do meu 1º tutorial passo a passo aqui no fórum
