Pelo que parece, o bug é conhecido:
Segundo os comentários, há uma relação entre esse bug e o novo GTK3.8. Infelizmente a cada nova versão do GTK, o pessoal anda a alterar as APIs, o que é um política de atualização muito errada de se fazer, mas infelizmente é o que tem acontecido. Ora com estas alterações de APIs a ocorrerem constantemente, a cada nova API os programadores têm de adaptar os seus programas a essas novas APIs.
Se se isto se confirmar que há mesmo esta relação entre esse erro e o GTK3.8, então basicamente temos de esperar até que o programador do Ubuntu Tweak adapte o programa para a nova API do GTK3.8.
Entretanto, você tem o Ubuntu Tweak atualizado? É que se calhar o programador do Ubuntu Tweak já mandou alguma correção. Só estou a especular, mas por vezes os programadores fazem estas alterações rapidamente.

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PS: eu não sei se alteraram a API do GTK3.8, mas que é um facto que desde que veio o GTK3 a API já mudou várias vezes, isso é! Eu próprio já tive de alterar várias vezes do
Ubuntued-deskmod por causa disso!